A bordo dell'Enterprise, Kirk e il suo equipaggio sono scossi per la recente perdita di Spock. Durante la fase di rientro sulla Terra il dottor McCoy assume però uno strano comportamento: inizia a parlare e comportarsi proprio come il defunto amico. Numerosi dubbi affollano le menti dei membri dell'equipaggio. Spock è davvero morto? E se il suo corpo si fosse reincarnato? Se tutto questo fosse vero, al capitano Kirk non resterebbe altro che andare recuperare l’amico vulcaniano sul pianeta Genesis. La missione dell'Enterprise sarà però più ardua del previsto.