Il primo episodio inizia con Indiana Jones, brillante docente di archeologia, nella selva amazzonica alle prese con un idolo protetto da trappole mortali. Nonostante le risorse atletiche e di astuzia, però, l’idolo è destinato a finire in altre mani. Tornato all'Università di Princeton, Indiana insieme al suo collega e amico Marcus Brody, riceve la visita di due agenti governativi che recano un avvertimento per loro: siamo negli anni ’30 e i nazisti stanno per impossessarsi dell’Arca dell'Alleanza, l’antico contenitore delle tavole mosaiche di cui si è persa traccia dalla distruzione del Tempio di Gerusalemme, in grado di garantire poteri sovrannaturali a chi lo possiede.