Siamo nel 1938: Indiana Jones scopre che il suo laconico e inflessibile padre Henry, anch'egli stimato archeologo, è stato rapito perché vicino a individuare il luogo segreto dove è custodito il Santo Graal, il calice che secondo la leggenda avrebbe contenuto il sangue di Cristo. Malgrado i rapporti da sempre burrascosi, Indiana si mette sulle tracce del padre, riuscendo a liberarlo dal castello austriaco in cui è tenuto prigioniero dai nazisti. La corsa per arrivare al Graal prima dei nemici porterà padre e figlio in una cripta scavata nella viva roccia, in Terrasanta, ma l’emozione di stringere il mistico calice è destinata a durare poco.