Dopo essersi vendicato, aver scoperto la sua vera identita' e quello che crede essere l'obiettivo dei suoi creatori, Bourne sembra aver trovato un po' di pace e scompare di scena. Ma viene attivato un nuovo programma - sviluppato da una struttura di potere globale piu' intricata e ambigua rispetto al periodo delle superpotenze in cui Bourne e' stato creato - cosi' viene gettato allo scoperto da una rete molto piu' funzionale e piu' pericolosa di qualsiasi singolo governo. L'obiettivo unico di questo agglomerato di potere e' quello di utilizzare a proprio favore il terrorismo, la tecnologia e l'insurrezione, per portare a termine il suo piano finale. Mentre i suoi inseguitori credono che Bourne si presentera' per farsi ricondizionare, se, in cambio gli offriranno cio' che piu' desidera al mondo, ovvero l'arma piu' elitaria che sia mai stata progettata, Jason sa una cosa che i suoi inseguitori non riescono ad afferrare: anche i soldati piu' addestrati difendono gli innocenti dal potere incontrollato...