L'ex agente segreto della Cia, Jason Bourne (Matt Damon), colpito da un'amnesia, trascorre una vita tranquilla a Goa, in India, assieme a Marie, la sua donna. Un killer al servizio di un misterioso uomo d'affari russo lo rintraccia e cerca di ucciderlo. Ma il piano fallisce e Marie rimane ferita a morte. Convinto che dietro l'uccisione della ragazza ci sia la Cia, Bourne torna a vestire i panni di un tempo deciso a dare la caccia ai suoi ex-colleghi dei servizi segreti.